創作如複眼般多端
1997年，他以新人之姿出道，陸續出版短篇小說《本日公休》、《虎爺》。
而後，著迷於自然的他，取徑「自然寫作」，推出《迷蝶誌》、《蝶道》、《家離水邊那麼近》等作品。
即便，大家一度以為，順利在此領域取得一席之地，必將循此路持續耕耘。私下堅信「小說是創作核心」的吳明益，卻將對環境生態的關照，結合歷史素材、小說敘事，走上了另一條無人意料到的路。
《睡眠的航線》取材台灣二戰時期少年工的歷史，獲選 2007 年《亞洲週刊》中文十大好書。
《複眼人》結合原住民元素、海漂垃圾等議題。國際媒體譽為「台灣版的《百年孤寂》」；2014年獲法國島嶼文學獎小說獎；2022年入圍日本星雲獎「年度最佳翻譯小說」。也改編舞台劇，由台法文化獎得主、德籍導演盧卡斯．漢柏執導。
《天橋上的魔術師》以已拆除的台北中華商場為背景創作為短篇小說。2018年入圍法國愛彌爾‧吉美亞洲文學獎決審。漫畫家阮光民改編為圖文小說。公視改編為劇集，由楊雅喆執導。
《單車失竊記》串聯單車工藝與台灣歷史。2018年入圍英國曼布克國際獎，創下台灣文壇首例。
《苦雨之地》是以台灣特有物種為角色的奇幻故事。導演陳芯宜據其中一篇作品改編為VR作品〈雲在二千米〉，獲威尼斯影展沉浸式內容競賽單元大獎。
《海風酒店》關照土地開發與環境保護的議題。獲 2023 年《亞洲週刊》中文十大好書。
彷彿已立足作家生涯顛峰，他卻出人意料地拾起畫筆，據《海風酒店》中的其中一篇短篇，推出繪本《三隻腳的食蟹獴與巨人》。
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