未來隨著進駐廠商的增加，自由港區的經濟效益將會像漣漪般向外擴散，然而眼前，光是港區本身及周邊配合設施的建設，也足以釋出一塊塊誘人的大餅，讓業者分霑搶食。

以已經取得民航局優先議約權的遠翔空運倉儲公司為例，由於遠翔將掌握興建桃園航空貨運園區長達五十年的合約期，未來勢必會順水推舟，參與自由貿易港區的設置，而樂觀預估可以帶來新台幣九百七十五億元的潛在獲利。

經建會副主委何美玥指出，遠翔所參與的桃園中正機場貨物運輸區開發計劃，為交通部民航局配合政府推動「亞太營運中心計畫」及「全球運籌中心」的重要航空建設之一，也是民航局近年來釋出的最大一項與民間合作的ＢＯＴ計畫。未來政府會優先指定該區為自由貿易港，可以享有區內免關稅、營業稅、貨物稅、及相關稅費減免等優惠。

類似實質挹注經濟活力的個案，還包括規劃中的台北港。經建會在「台北港整體規劃與未來發展計劃」中，已決定將進港貨櫃船型由5000TEU提昇到8000TEU，第一貨櫃中心貨櫃碼頭也由原本的六席增加為七席，同時為配合市場需要，還將分兩階段擴建南碼頭區。何美玥表示，其中第一貨櫃中心的興建，將是台灣地區最完整、最現代化的遠洋貨櫃基地，可以大大減少「北櫃南運」（北台灣貨櫃依賴高雄港出口）的成本支出，並因應貨櫃船日益大型化的趨勢需求，以增強國際貿易競爭力。

目前，台北港第一貨櫃中心ＢＯＴ部分已經開跑，由長榮等公司取得議價權，將在民國九十五年完工。而台北港如果想要成為自由貿易港，必須先申請成為國際港，為未來發展確定更廣大的方向，業者運用起來才不會綁手綁腳。

在行政院版本條例中，未來區內廠商可從事深層加工，預期可以吸引外商投入，帶動新一波投資潮，藉此擺脫長期滯銷的陰影。目前高雄港區正由經濟部國營會提出構想，希望能充份吸納港區內、特別是大型石化園區的產業實力；而中正機場則由桃園縣長朱立倫坐陣，指示相關的聯外道路及配套措施一定要先規劃完成，並建議將觀塘港開發為工商綜合港，除配合自由貿易港區計劃作為中正機場的發展腹地外，更希望結合高鐵青埔站的發展，作為未來兩岸三通後的重要港埠，展現海、陸、空聯合出擊的利基。然而，觀塘港雖然是北部唯一的工業港，但因開發計畫目前仍在經濟部工業局審議中，所以能否配合納入自由貿易港區的範圍，還要觀察。

高雄方面，國營會副主委呂桔誠則透露，國營會將整合經濟部在高雄市港所擁有的一八三．五公頃土地，朝資源整合和促進民間參與等五大發展策略著手，全力配合高雄市發展為自由貿易港區。

為了這項宣佈而專程南下的呂桔誠，望著大高雄集製造業基地、腹地、海港、貨櫃集散場於一身的優勢，簡單分析了未來的作法。他說，首先是配合高雄市港建設，作整體的土地及產業再規劃；其次是國營事業角色功能的轉型，也就是由二級產業的製造生產功能，蛻變為物流倉儲、貨櫃運輸、貿易展覽和國際會議中心等服務業性質的三級產業。

根據自由貿易港區設置管理條例草案，自由港區內的事業，包括貿易、倉儲、物流、組裝、重整、包裝、修配、加工、製造、展示或技術服務事業，而其周邊的支援性及輔助性事業，例如裝卸、打拆盤、承攬運送、報關服務、金融、餐飲、旅館、會議等事業，也都可以一體適用該條例。

立委邱太三指出，企業一旦進入自由貿易港區，追求的就是節省時間、統籌管理，因此各項營運流程都應力求順暢，例如在區內召開國際會議就是相當必要的，「國際級企業營運總部所需要的任何便利措施，我們現在都要以條例作為明確保障，才不會發生以前工商綜合區內的莫名違法事件。」

想想看，未來在自由貿易港區內的企業，會因具備區域營運中心的地位而備受青睞，得到最好的行政支援。例如，某公司為盛大召開亞太區經營大會，只需要向分散世界各地的業務代表發出電子郵件邀請函，而不必再有事前的繁瑣簽證申請；在約定的日子到來時，港區內的會議公司已經安排好區內旅館的訂房，而餐飲公司也會就近把新鮮餐點定時送到會議場所，短短一、二天的開會期間，所有行政體系都在幕後靜靜運作，而企業本身只需要集中心力在會議上即可。

由於自由貿易港區實在誘人，部份沒有被納入第一批設置標的考慮內的港口，如和平港，或是各縣市工業園區等，也都已展開大力爭取的動作。

實際上，自由貿易港區的經濟效益，離實現還有一段距離。以麥寮港為例，目前由台塑集團投資，希望結合開發中的新興區為自由貿易港區。這個新興區鄰近麥寮港，現委託榮民工程公司甫完成東一區填海造地約一百七十公頃，預計東一區全部二百六十多公頃完工後，將可以成為自由貿易港區腹地；但如果未來再開發東二區二百八十公頃，腹地將超過五百公頃。業界認為，麥寮港若真能設置為自由貿易港區，並成為兩岸直航港口，台塑集團甚至不必赴大陸投資輕油裂解中心，只需由六輕直接供應在大陸的中下游廠商，成為兩岸垂直分工的典範。

對此，何美玥認為，在條件適合的地方設置自由貿易港區，才能真正發揮經濟效益，否則只是浪費資源。

就經建會的構想，最適合設置為自由貿易港區的標的，應是國際機場，而且須擁有高科技產品依賴的國際航線，「高科技產品體積小、附加價值高、講求交貨時效，」何美玥認為，國人還是先集中力量在第一批的高雄國際機場、桃園中正機場，才是自由貿易港區設置成功的良方。